摘要
近日,在Nature genetics雜志上發(fā)表了一篇題為“Common genetic variants and modifiable risk factors underpinhypertrophic cardiomyopathy susceptibility and expressivity”的文章,該文章經(jīng)全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS),鑒定出了12個(gè)HCM全基因組顯著易感性基因座。單核苷酸多態(tài)性(SNP)的可遺傳性顯示出較強(qiáng)的多基因影響,特別是對(duì)于肌小節(jié)陰性的HCM(64%的病例;h2g?=?0.34?±?0.02)。在一項(xiàng)驗(yàn)證性研究中,遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分對(duì)HCM的發(fā)生率有顯著影響,最低五分位的發(fā)生率減半,最高五分位的發(fā)生率翻倍,同時(shí)也影響了肌小節(jié)變異攜帶者表型的嚴(yán)重程度。孟德?tīng)栯S機(jī)化研究指出,舒張壓(DBP)是肌小節(jié)陰性的HCM的關(guān)鍵可變危險(xiǎn)因素,DBP的標(biāo)準(zhǔn)差增加會(huì)使HCM風(fēng)險(xiǎn)增加四倍。常見(jiàn)的遺傳變異和可改變的危險(xiǎn)因素在HCM中有重要的作用,建議在臨床上進(jìn)行相關(guān)檢測(cè)。
背景介紹
肥厚型心肌病(HCM)是一種常見(jiàn)的、嚴(yán)重的遺傳性心臟病,每500人中至少有1人患肥厚型心肌病,是成人早期和中期猝死,栓塞性中風(fēng)和心力衰竭的主要原因。肌小節(jié)性HCM是由肌絲基因突變引起的,是一種常染色體顯性遺傳疾病。然而,HCM具有外顯率低、表達(dá)可變的特點(diǎn),這使診斷和預(yù)后面臨很大的挑戰(zhàn)。在更常見(jiàn)的肌小節(jié)陰性的情況下,病例往往是獨(dú)立的,但在家庭中常呈聚集性,這就需要在家庭中進(jìn)行臨床監(jiān)測(cè)。
研究對(duì)象
研究對(duì)象為肥厚型心肌病登記處(HCMR)和罕見(jiàn)疾病生物資源(BRRD)中無(wú)關(guān)的HCM患者。單核苷酸多態(tài)性(SNP)的可遺傳性使用GREML-LDMS進(jìn)行計(jì)算,很大一部分HCM風(fēng)險(xiǎn)可歸因于常見(jiàn)(次要等位基因頻率(MAF)>0.01)SNPs(HCMRh2g=0.35±0.01; BRRD h2g=0.68±0.16))的累加效應(yīng)。最終對(duì)2,780例HCM患者和47,486例年齡和性別匹配的對(duì)照進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)數(shù)據(jù)集的固定效應(yīng)逆方差meta分析,共分析了8,590,397個(gè)SNP。
研究結(jié)果
對(duì)所有HCM患者(包含肌小節(jié)陽(yáng)性和肌小節(jié)陰性)進(jìn)行分析,在12個(gè)基因座(P<5×10?8)中鑒定出13個(gè)獨(dú)立的全基因組顯著變異(見(jiàn)表1)。
表1 在全基因組顯著性閾值下與HCM獨(dú)立相關(guān)的變異
FHOD3基因座包含兩個(gè)獨(dú)立的全基因組顯著變異,rs4799426和rs118060942,并處于連鎖平衡(r2=0.01)。除了FHOD3之外,所有的基因座都是新發(fā)現(xiàn)的,FHOD3此前在HCM GWAS中有報(bào)道。此前的候選基因研究報(bào)道了BAG3和FHOD3與不同類(lèi)型心肌病中的罕見(jiàn)變異相關(guān)聯(lián),BAG3和HSPB7基因座與擴(kuò)張型心肌?。―CM)的常見(jiàn)變異相關(guān)聯(lián)。在HCM和DCM共有的基因座上,作用方向是相反的,HCM風(fēng)險(xiǎn)等位基因此前被證明可以降低DCM的風(fēng)險(xiǎn)。雖然其他一些基因座也編碼已知的心肌病基因(PLN和TTN),但未顯示主要的HCM和DCM肌絲基因座,這與導(dǎo)致這些基因改變蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)而不是表達(dá)水平的心肌病一致。排除極端多效性的rs28768976和由于致病性MYBPC3變異的長(zhǎng)程連鎖不平衡而導(dǎo)致的rs78310129后,對(duì)所有HCM meta分析顯示,在5%FDR閾值下表現(xiàn)出與HCM獨(dú)立關(guān)聯(lián)的27個(gè)SNPs被匯總到一起,通過(guò)遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分(GRS)進(jìn)行預(yù)測(cè)。在三個(gè)獨(dú)立HCM隊(duì)列(包括1,769例患者和39,828例對(duì)照)的驗(yàn)證性meta分析中,通過(guò)GRS預(yù)測(cè)了HCM的發(fā)生率(見(jiàn)圖1)。以60%的人群作為對(duì)照組,對(duì)最低五分位的個(gè)體有保護(hù)作用(OR=0.53(95% CI=0.45-0.63)),對(duì)最高五分位的個(gè)體其HCM的發(fā)生率增加兩倍以上(OR=2.30(95% CI=2.02-2.62))。與h2g評(píng)估一致,GRS在肌小節(jié)陰性的亞組中顯示出更大的效應(yīng)(見(jiàn)圖1)。然而,在攜帶致病性肌小節(jié)變異的年輕人中,成年后患顯性心肌病的概率通常為50%,這對(duì)于患心肌病的平均風(fēng)險(xiǎn)減半或加倍可能具有臨床意義。圖1 HCM GRS的驗(yàn)證
為了確定常見(jiàn)的易感性變異是否影響肌小節(jié)陽(yáng)性的HCM患者的疾病嚴(yán)重程度,評(píng)估了具有相似變異機(jī)制的病例組中GRS對(duì)左心室肥大的影響。GRS每增加1個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差,MYBPC3截短變異攜帶者(n=232)最大左室壁厚度增加0.71±0.35 mm(P=0.048),而MYH7錯(cuò)義變異攜帶者(n=186)最大左室壁厚度增加0.73±0.36 mm(P=0.037)(見(jiàn)圖2)。圖2 標(biāo)準(zhǔn)化GRS與最大左室壁厚度之間的關(guān)系
觀察性研究表明,高血壓、肥胖和2型糖尿病在HCM患者中更為普遍,但這些可能是由于運(yùn)動(dòng)量減少引起的。本研究采用孟德?tīng)栯S機(jī)化的兩個(gè)樣本,對(duì)這些可遺傳性狀進(jìn)行大規(guī)模的GWASs分析,推斷高血壓和肥胖與HCM的因果關(guān)系,而非糖尿病。最值得注意的是,舒張壓(DBP)似乎是肌小節(jié)陰性的HCM發(fā)生的主要危險(xiǎn)因素。DBP(11.3 mmHg)每增加1個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差,可導(dǎo)致HCM風(fēng)險(xiǎn)增加四倍(OR=3.93 (95% CI=2.86–5.41);P=3.74×10?16),與DBP相關(guān)的其他疾病的風(fēng)險(xiǎn)增加一倍以上(見(jiàn)圖3)。圖3 DBP對(duì)肌小節(jié)陽(yáng)性和肌小節(jié)陰性HCM的易感性與其他已確定的高血壓相關(guān)表型的相對(duì)影響結(jié)論與展望
在這項(xiàng)研究中確定的個(gè)體基因座對(duì)于推動(dòng)心肌病發(fā)病機(jī)制的新見(jiàn)解具有巨大的潛力。其研究結(jié)果強(qiáng)調(diào)了常見(jiàn)變異對(duì)HCM發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的重要影響。在具有致病性肌小節(jié)變異的個(gè)體中,多基因的貢獻(xiàn)較弱,但一種常見(jiàn)的變異GRS在這里可能特別有用。此外,常見(jiàn)變異似乎可以解釋致病性肌小節(jié)變異的部分可變表達(dá)。GRS的臨床應(yīng)用需要在足夠有力的HCM疾病進(jìn)展的縱向調(diào)查中進(jìn)行研究,尤其是在當(dāng)前數(shù)量有限的肌小節(jié)陽(yáng)性患者中的研究。在缺乏肌小節(jié)基因的主要致病性變異的個(gè)體中,建議多基因風(fēng)險(xiǎn)分布的極端情況(例如,人群的前1%)與因果風(fēng)險(xiǎn)因素相結(jié)合,會(huì)驅(qū)動(dòng)個(gè)體易感性。多基因風(fēng)險(xiǎn)和DBP是主要的可改變的危險(xiǎn)因素,可以極大地幫助管理肌小節(jié)陰性的HCM患者及其親屬。參考文獻(xiàn)
Harper A R, Goel A, Grace C, et al. Commongenetic variants and modifiable risk factors underpin hypertrophic cardiomyopathysusceptibility and expressivity. Nat Genet. 2021 Feb; 53(2): 135-142.關(guān)于肥厚型心肌病及相關(guān)內(nèi)容的更多介紹,詳見(jiàn):
· CSRP3 p.(Cys150Tyr)變異與雜合個(gè)體的遲發(fā)性肥厚型心肌病相關(guān)