背景介紹:擴張型心肌?。―CM)是一種在無冠狀動脈疾病或負荷異常情況下,以左心室擴張和收縮功能障礙為特征的心肌病。已報道有50多個基因與DCM相關(guān),該病主要為常染色體顯性遺傳,且外顯率不全。
近日,在《European Heart Journal》上刊登了一篇名為“Genome wide association analysis in dilated cardiomyopathy reveals two new key players in systolic heart failure on chromosome 3p25.1 and 22q11.23”的文章,有助于更好地理解DCM的遺傳結(jié)構(gòu),并揭示心臟衰竭新的生物學途徑。
研究方法
在擴張型心肌病中進行了迄今為止最大的全基因組關(guān)聯(lián)研究,在發(fā)現(xiàn)隊列中有2719名受累個體和4440名健康對照,復制隊列中有584例受累個體和963例健康對照。全文摘要概述可參考圖1;
圖1 圖文摘要。第一步:通過迄今為止對擴張型心肌病進行的最大的全基因組關(guān)聯(lián)研究,在染色體3p25.1和22q11.23上鑒定并重復了兩個新的位點;第二步:結(jié)合相關(guān)位點的硅和功能分析揭漏了每個位點上的最有可能致病基因:SLC6A6(3號染色體)和SMARCB1(22號染色體)。這兩個新角色的發(fā)現(xiàn)揭示了新的生物學途徑和假定的新的治療靶點。
研究結(jié)果
確定了與擴張型心肌病相關(guān)的四個位點。其中,位于10號染色體的BAG3 rs61869036 和1號染色體的HSPB7 rs10927886是已知的。鑒定和重復了兩個新的相關(guān)位點:位于3p25.1號染色體[單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點rs62232870,分別在發(fā)現(xiàn)和重復隊列中P=8.7×10-11和7.7×10-4)]和22q11.23號染色體[(SNP 位點 rs7284877,分別在發(fā)現(xiàn)和重復隊列中P=3.3×10-8和1.4×10-3)]。
根據(jù)這四個擴張型心肌病基因座的風險等位基因數(shù)構(gòu)建的遺傳風險評分顯示,與具有5個風險等位基因的個體相比,具有8個風險等位基因的個體患擴張型心肌病的風險增加了27%,具有1種風險等位基因的個體換擴張型心肌病的風險降低了21%。
iPSC衍生心肌細胞的硅注釋和功能4C測序分析表明,在3p25.1染色體上SLC6A6基因最可能導致DCM。該基因編碼?;撬徂D(zhuǎn)運體,其參與心肌功能障礙和DCM,并在人類和動物身上的大量觀察結(jié)果支持了這一觀點。
在22q11.23位點,在硅片和數(shù)據(jù)挖掘注釋中,以及在較小程度上的功能分析,強烈建議SMARCB1基因作為候選致病基因。
小結(jié):迄今為止對DCM進行的最大的全基因組關(guān)聯(lián)研究揭示了3p25.1和22q11.23染色體上兩個新的DCM相關(guān)位點(在兩個位點中最有可能的致病候選基因分別是SLC6A6和SMARCB1),并構(gòu)建一個多基因風險評分來更好地預測DCM的風險。這項研究為DCM的遺傳結(jié)構(gòu)提供了更好的理解,鑒定了與收縮性心力衰竭病理生理學的新參與者,具有新的治療發(fā)展?jié)摿Α?/p>
更多心肌病相關(guān)信息,詳見:
《JACC新發(fā)現(xiàn)——心臟基因型可以增加心肌炎風險》